在五二○馬總統就任前一個多月，一些學者公開呼籲將總統府、總統官邸還給台灣人民，以達到真正的空間解嚴。過沒幾天，馬先生在向政大台文研究所長陳芳明請益後，釋放了想在關渡另蓋行政中心辦公的訊息，一時媒體大幅報導，有地方首長建議其他適當地點，更有人提出遷都高雄的構想。遷府或遷都的最主要理由，是現在的總統府所在地是日本殖民時期的總督府，歷史的部份應該還給歷史，所以許多人主張改為博物館。

中央行政機關的佈局，往往反映出國家的政府體制。例如美國的總統府白宮，是總統辦公兼居住的地方，而美國的國會大廈其建築之宏偉，規模之龐大，超過白宮，顯示美國崇尚自由民主的精神。在顯見行政、立法、司法三權分立當中，由民意代表組成的立法機構，更受重視。我國的總統府，歷經殖民威權統治，整棟建築透著一股肅殺之氣，而其戒備森嚴，門口又橫著一條馬路，完全沒有任何親民的感覺。這是軍事統治下的結果，人民早已習慣，也已普遍接受。再者，我們憲法賦與總統的權力與職位也是高高在上的，恰恰也反映在總統府的格局上。

不過，目前中央行政機關建物布局有些地方確實與我們的憲政體制不合，例如與總統府關係密切的行政院，以及負責監督行政的立法院，位置都太分散，距離也過遠。較理想的安排是，行政院搬到總統府旁，而過去國民黨中央黨部的位置應該設置立法院。

無論如何，現在總統府已開放一般民眾參觀，假日還可以自由拍照。透過這個開放活動，總統府或多或少減低了威權感，拉近與民眾的距離。如果要全面更動，增加參觀內容，則可以考慮將一樓做博物館，國防部則搬遷出去。

有關遷府或遷都的問題，自馬總統就任之後，就沒有人再討論。畢竟百廢代舉，總統府的問題，比起其他施政，已無迫切性可言。既然民眾已普遍接受現況，那麼遷或不遷，已經沒那麼要緊，何況現在也不太有人去關心了。如果要變動或搬遷，那就等更重要的國政問題解決了再說。