目前兩岸正在針對投資保障協議進行談判中，除雙方爭執不下的人身安全議題外，專利權保護也是另一個重要的議題。鴻海董事長郭台銘於6月19日公開呼籲政府：「將來科技業就是專利戰、智財權戰爭，而這是目前台商在大陸投資的最大問題。這次投保協定一定要有智財權的保障協定。」
鴻海在大陸投資相當驚人，在大陸也申請為數眾多的專利權，然即使這樣的企業，在大陸的智慧財產權（主要是專利權及營業秘密）仍受到嚴重的侵害。鴻海和比亞迪的官司為例，根據媒體報導，2006年比亞迪為進軍通訊代工市場，竟然派人至鴻海的子公司富士康竊取上萬筆的商業機密，並挖角500多人富士康研發團隊，進而搶走諾基亞和摩托羅拉訂單，並讓亞迪手機業務迅速崛起。
事後2007年富士康對比亞迪提起剽竊商業機密等訴訟，即便鴻海掌握比亞迪竊取鴻海1萬多份資料的鐵證如山，且仍無法打贏這場官司。富士康今年前5月是大陸創造出口最大的企業，在證據確鑿下仍無法獲得公平的判決，更何況是以中小企業為主的台商，其在智慧財產權上，就更難以受到保障了，足見將智慧財產權納入投保協議的重要性了。
根據經濟部投資審議委員會的統計，1991年至2011年12月為止，經政府核准台商赴中國大陸投資金額高達一千一百一十七億美金。而且這還只是官方核准的統計數據，若加上台商透過其他管道自行赴大陸的金額，數字將更為可觀。根據學者研究，若加計經香港、英屬維京群島、開曼群島轉投資的數據，實際投資金額將超過一千五百億美元，僅次於港澳；同時，台商在大陸的國際貿易總額達1兆8,053億美元；台商也創造了1,443多萬個就業機會。台商對大陸經濟發展的助力不言可喻，連大陸國家主席胡錦濤多次公開表示，台商對大陸經濟發展貢獻很大。
縱然台商在大陸發展已經多年，也透過大量的投資帶動當地的經濟起飛，但台商在大陸投資與商務糾紛屢見不鮮，雖目前大陸訂有「台灣同胞投資保護法」及其「實施細則」，中國大陸單以國內法保障台商權益確有保障不足之窘境，另由於中國地方保護主義盛行，使得台商循當地行政或司法救濟管道無法獲得公平裁決與執行，故台商在大陸投資面臨重大的投資風險。因而，我方積極要求與大陸簽訂「兩岸投資保障協議」。
兩岸對於一般性的投資事宜，亦即保障台商在大陸私人對政府之間在投資和糾紛上的權益，已經列入目前「兩岸投資保障協議」的草案之中，較無疑義。然而，對於台商在大陸和其他企業或私人個體的糾紛，大部分屬於侵權糾紛，尤其是專利權糾紛更是付之闕如，若此部分無法納入投保協議，對台商權益的保障形同缺了一大塊，大大減損台商的權益，相關法律風險難以解除。
在知識經濟時代，許多台商企業致力於研發，積極在大陸申請專利，以保護自身的發明，專利布局已經成為各大企業重要的商業策略。根據最新的國家知識產權局2011年統計，2011年大陸發明專利申請量居前十位的企業台灣企業就占了二個（詳見下表），其中鴻海子公司鴻富錦精密名次雖然由第二名下滑，2011年仍高居第四名。整體而言累計歷年的統計，台灣在大陸各省市中也高居第七名。惟台灣的統計數字尚不包含鴻富錦精密這類在大陸註冊的公司，若將這些公司包含進去，名次還將大幅提升。專利保護之重要性可見一斑。
2011年大陸發明專利申請量居前十位的企業（含港澳臺）
| 序號 | 企業名稱 | 數量（件） |
| 1 | 中興通訊股份有限公司 | 4685 |
| 2 | 華為技術有限公司 | 3617 |
| 3 | 中國石油化工股份有限公司 | 3122 |
| 4 | 鴻富錦精密工業（深圳）有限公司 | 2908 |
| 5 | 海洋王照明科技股份有限公司 | 1212 |
| 6 | 騰訊科技（深圳）有限公司 | 850 |
| 7 | 友達光電股份有限公司 | 758 |
| 8 | 中國石油天然氣股份有限公司 | 722 |
| 9 | 奇瑞汽車股份有限公司 | 718 |
| 10 | 中芯國際積體電路製造(上海)有限公司 | 635 |
資料來源：大陸國家知識產權局
加上近年來專利意識大幅提升，專利不再只是防禦型的工具，更是一項重要的武器。君不見蘋果電腦倚靠著幾項專利，縱橫世界各國，動輒對其他廠商提出專利訴訟。過去侵權廠商只要支付授權費或權利金即可了事，仍可繼續生產相關產品，惟近期專利商態度丕變，訴訟的目的不在獲取授權費或權利金，而在於將競爭廠商一舉踢出市場，進而獨享獨占利益。在此一趨勢下，專利保護已經成為相當重要的議題，政府有必要進一步擴大兩岸投資保障的範圍。
另外，此次簽署的兩岸投資保障協定不管納入專利權或是人身保障等，保護對象不僅僅是在大陸的台商，還包含在台灣投資的大陸企業，使得雙方的投資都能獲得更完整的保障。隨著台灣逐步開放陸資在台投資，相關商業糾紛也會跟著增加，透過此一機制的建立，將能使兩岸的企業皆能獲益，何樂而不為？
（本文刊載於2012年6月29日中央網路報）
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